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Imbarcare la recensione e la valutazione del kit di test del DNA del cane

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Video: TEST GENETICI KIT. Come funzionano? Quali implicazioni etiche? (Ottobre 2024)

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Anonim

Fondato dai fratelli scienziati dopo anni di studi sulla genetica dei cani, Embark ($ 199) presenta il più grande database di razze canine del suo genere. Controlla più di 250 tipi di cuccioli, nonché lupi, coyote, dingos e i cosiddetti "cani del villaggio". Questa ampiezza di analisi è fondamentale quando si tratta dell'accuratezza della determinazione della razza. Imbarco controlla anche il DNA del tuo animale domestico per segni di 165 condizioni mediche genetiche e può determinare se il tuo cucciolo è portatore o a rischio di contrarre una malattia in piena regola. Sono più test di mutazione di qualsiasi altro kit di test del DNA canino. Imbarcare è costoso e forse offre troppe informazioni, ma questi sono i suoi unici difetti.

Servizi di screening genetico

Embark è il kit di DNA per animali più costoso che ho testato ed è offerto solo in un kit a test singolo. Al momento in cui scrivo, potresti ottenere un prezzo migliore se testi più cani (usa il codice coupon "MULTIPACK" sul sito Web di Embark), con uno sconto massimo del 20% su quattro o più kit. Rifugi, allevatori e veterinari possono anche ottenere sconti. Ma come dice il proverbio, ottieni quello per cui paghi. La dichiarazione sul sito di Embark afferma che il suo processo di identificazione della razza "verifica oltre 200.000 marcatori genetici e costruisce il cromosoma della miscela del tuo cane con il cromosoma".

Durante il processo di registrazione, che è necessario eseguire prima di inviare il campione, Embark richiede l'autorizzazione per utilizzare il campione per la ricerca. Embark è partner del Cornell University College of Veterinary Medicine - aiuta il co-fondatore Adam Boyko a essere un professore lì - quindi i ricercatori sono al corrente dei dati di Embark. L'azienda lavorerà anche con ricercatori esterni che utilizzano le informazioni sui test del DNA, come gli attuali partner VetGenomics e Doberman Diversity Project.

Collezione DNA

L'imballaggio di Embark si distingue dalla concorrenza. Ad esempio, mi piacciono le istruzioni illustrate chiare e concise del kit. Una scheda all'interno mostra tutte le istruzioni, inoltre elenca gli URL che è possibile visitare per attivare il kit, guardare gli elenchi di razza, imparare a tamponare la guancia di un cane per ottenere un campione e altro ancora.

Nel pacchetto è presente anche un dog tag "missile" in acciaio, con un URL sul retro. Se il tuo cane si perde, chiunque lo trovi può utilizzare l'URL per accedere ai dati condivisi sul cane. Se detta persona chiama il numero di telefono sul tag, Embark agirà come una terza parte per accoppiare il cercatore e il proprietario. In altre parole, Embark non distribuirà solo le informazioni di contatto personali.

La prima cosa che fai, ovviamente, è attivare il kit, proprio come con i kit di DNA umano. Hai la possibilità di utilizzare gli accessi di Facebook o Google o di creare un account con il tuo indirizzo email. Se hai più kit per più cani, registra tutti i kit sullo stesso account per un facile accesso online. Una volta che il tuo account è attivo, crea un profilo cane per ogni kit che desideri attivare e registra ciascuno con i numeri di un kit Embark.

Qui, puoi anche decidere se vuoi che i dati del tuo cane contribuiscano alla ricerca medica e scientifica (ne parleremo più avanti). Imbarco ti informa inoltre che invierà aggiornamenti via e-mail e, se lo desideri e sei negli Stati Uniti, SMS Messaggio.

Gli avvertimenti sulla parte superiore del pacco indicano di non schiacciare la scatola, poiché funge anche da contenitore per la spedizione di ritorno per il campione di DNA. Questo è l'unico test del DNA del cane che ho visto che richiede un singolo tampone, il resto richiede due campioni. La spugna della collezione Embark arriva all'estremità di un contenitore di plastica riempito con un fluido stabilizzante. Tampona la tasca della tasca inferiore della guancia di un cane (tra gomma e guancia, preferibilmente senza che la masticino) per 30 secondi, ovvero 10 secondi in più rispetto alla concorrenza. Svitare l'unità, invertirla e posizionare la spugna nel fluido. Scuotilo delicatamente per 10 secondi e il campione è pronto per essere inviato per posta. Imbarca apparentemente usa un campionatore di una società chiamata DNAGenotek; di seguito è riportato il video delle istruzioni utilizzate sul sito di Embark:

I test sui tamponi di DNA della competizione prevedono semplicemente di gettare alcuni tamponi di cotone lunghi in una busta. Il test di Embark sembra più tecnologico e affidabile, anche se non c'è modo di esserne sicuri. Questo è lo stesso metodo utilizzato dal tester del DNA umano MyHeritage DNA. Dopotutto, non puoi davvero sputare i cani a sputare in un tubo, come fanno gli umani con 23andMe.

Seguire le istruzioni per inserire il campione nella busta di plastica inclusa, schiaffeggiarlo tutto nella stessa scatola in cui è entrato e chiudere il lembo. Inseriscilo nella posta. Il mio è andato al laboratorio di Embark presso il suo quartier generale a Boston. Tutte le spese postali sono prepagate.

La stima per ottenere la risposta da Embark è di due o quattro settimane. Ho ricevuto una risposta su un kit in 19 giorni; il secondo campione si è presentato con i risultati della razza in 21 giorni (con un giorno in più per la visualizzazione delle altre informazioni). Questo è un ottimo tempo di ritorno.

Rapporti DNA e funzionalità extra

Embark tiene un rapporto di esempio online, con Harley, il cane "ridicolmente fotogenico" del CEO. (Il cane è, in effetti, fotogenico.) Una volta inviato il campione, Embark ti tiene informato via e-mail durante tutto il processo. Ho ricevuto un'e-mail che diceva che il kit era in viaggio meno di tre ore dopo che l'ho lasciato all'ufficio postale. Mi è stato notificato l'arrivo del campione in laboratorio, l'inizio della genotipizzazione, quando i genomicisti (scienziato specializzato in genomi) avrebbero esaminato il campione e, infine, un'e-mail che diceva che i risultati erano presenti. Ho anche ricevuto un film per quel film schifoso Alpha perché Embark ha un accordo con esso. I risultati sulla salute a volte richiedono più tempo per essere mostrati rispetto ai risultati di razza.

A differenza degli altri test del DNA che abbiamo fatto, Embark inserisce molti dei risultati in quella e-mail finale, tra cui un piccolo grafico a ciambella con i risultati della razza iniziale e anche un piccolo suggerimento di quanto il DNA di lupo è nel tuo cane puramente domestico. Per i risultati completi, accedi tramite il sito My Embark. Qui puoi anche stampare report PDF, sebbene non tutti i dati online vengano visualizzati nel PDF.

La mia metodologia consisteva nel testare un cane di razza pura (Griffin) una volta e vedere se la società di test avrebbe ottenuto la razza giusta, quindi testare il mio compagno di razza mista (Madison) due volte, una volta con un falso nome ("Daisy") e un nuovo account: per vedere se i risultati sono stati gli stessi entrambe le volte. Considerando che i test sono stati forniti da Embark per i nostri usi, è possibile che sia in grado di tenere traccia dei numeri di campione inviati a PCMag e tenere d'occhio tali trucchi, ma sembra un sacco di lavoro.

I risultati

La prima tappa che probabilmente vorrai fare nei risultati completi è il pulsante Breed. Sono felice di riferire che Embark pensava che Griffin fosse un Golden Retriever al 100, 0 per cento, il che concorda con alcuni altri test del DNA, oltre al proprietario e allevatore di Griffin.

Madison, ovviamente, è tornato con un mix di razze dappertutto: 34, 2% American Pit Bull Terrier, 17, 5% Shetland Sheepdog, 13% Labrador, 12, 4% English Springer Spaniel, 9, 1% Bull Terrier, 7, 1% tedesco Shephard Dog (GSD) e Rottweiler al 6, 7 per cento. Nessun altro test del DNA l'ha fissata con Springer o GSD nei suoi geni.

Che cosa è successo con il secondo test di Madison (alias "Daisy")? Erano presenti tutte le stesse razze, con percentuali leggermente diverse rispetto a quelle nel mezzo.

È interessante notare che la migliore razza di Embark per Madison è Pit Bull Terrier e non l'American Staffordshire Terrier, entrambi in genere vengono raggruppati insieme sotto il moniker "pit bull", ma c'è una differenza, almeno in termini di dimensioni e aspetto. American Staffordshire Terrier è stata la scelta migliore per Madison da altri test del DNA, come il Wisdom Panel.

La sezione Razza fornisce anche alcune informazioni sulle famiglie di razze nel trucco del cane, oltre a dare un'occhiata all'aplotipo (sequenza del DNA) per la madre e il padre del cane, mostrando anche mappe di dove potrebbero aver avuto origine gli antichi antenati del cane. Questa è roba banale, e alcuni (come le mappe) sembrano riempitivi.

Gli alberi genealogici di Madison e "Daisy" erano identici. I test di DNAffirm e DNA My Dog non sono stati coerenti nemmeno con se stessi, mettendo in dubbio ogni loro fiducia. Non così con Embark. La vista dell'albero genealogico rivela la genitorialità della razza. Nota che Griffin non ha nemmeno guadagnato un albero, il che va bene, poiché sarebbe tutto Goldens.

Salute e altro

Sfogliare la sezione Razza sotto l'ingresso del tuo cane è solo l'inizio. La sezione Ricerca richiede lavoro da parte tua, il proprietario del cane, è per coloro che intendono contribuire alla scienza con il DNA del loro cane. Intraprendi la speranza di compilare alcuni piccoli sondaggi per rendere utile quel contributo, su argomenti come la salute dentale del tuo cane, i problemi comportamentali e le allergie e un sondaggio medico completo. È esattamente tanto divertente quanto ti aspetteresti: nessuno. Tuttavia, fallo se vuoi guadagnare la piena esperienza di rendere il mondo migliore tramite il genoma del tuo cane.

La sezione Salute è senza dubbio la più importante, in quanto contiene i risultati di tutti i test eseguiti per le mutazioni genetiche che il tuo cane potrebbe avere o almeno portare. I risultati di Griffin erano perfettamente chiari, in linea con i risultati del Wisdom Panel. Anche i risultati di Madison erano d'accordo: è una portatrice di mielopatia degenerativa, ma non la trasmetterà da quando ha sterilizzato. Anche se in chiaro, questa sezione mostra le condizioni comuni per le razze del cane. La maggior parte di tali informazioni sarà di interesse solo per le persone che hanno un cane a rischio, ma l'opzione è lì per leggere tutti i 165.

Si noti che il rapporto di Madison mostra solo i risultati per 162 test totali, non i 165 pubblicizzati. Il rappresentante dell'azienda ha dichiarato: "se i nostri algoritmi non sono sicuri al 100% di una chiamata sanitaria, non la chiameranno". Se esiste un test specifico su cui un cliente desidera risultati e non lo vede, non dare per scontato che sia negativo. Imbarco esaminerà manualmente un risultato su richiesta del proprietario del cane.

Ci sono collegamenti nella sezione Salute per creare un rapporto facile da condividere o stampare per i veterinari. Se il cane è di razza, esiste anche un link per inviare un rapporto sui risultati genetici alla Orthopedic Foundation for Animals (OFA), un'organizzazione che vuole ridurre le malattie genetiche negli animali da compagnia.

Infine, c'è una sezione avanzata per mostrare i risultati che solo un genetista potrebbe capire. Suddivide informazioni come la quantità di DNA di razza trovata su ciascuno dei 38 cromosomi, il tutto in una colorata serie di grafici. Scorri verso il basso per informazioni sulla diversità genetica del cane, che fornisce una misura effettiva della consanguineità (quanto sono strettamente collegati i genitori del cane). Più sono i consanguinei, più possono essere le condizioni ereditate geneticamente. I genitori di Madison the Mutt avevano un coefficiente di consanguineità dello 0 percento; ma i genitori di razza del Griffin avevano il 23 percento di una proporzione di geni identici in entrambi i genitori.

Se sei un mago nella lettura dei genomi, Embark ti consente di scaricare file ZIP con circa 7 megabyte di dati non interpretati dei 200.000 marcatori nei campioni. Quello che faresti con questo è l'ipotesi di chiunque.

Il rapporto Traits è in qualche modo interessante, mostrando i loci genetici che incidono sui colori e sui cappotti. È di nuovo gravato dal parlare di cromosomi e collegamenti ad altri cani Embark che hanno risultati simili. L'eccezione è la sezione Inbreeding Coefficient, che mostra quanto la mamma e il papà di un cane di razza condividano gli stessi geni. I genitori di Griffin hanno avuto un risultato del 23 percento (gente di Madison the Mutt: 0 percento). È stato interessante vedere anche "Daisy" mostrare lo stesso genotipo di Madison. Ma a lungo termine, la sezione dei tratti maniacali di Wisdom Panel è migliore per l'utente medio rispetto ai dati più complicati di Embark.

Conclusioni genetiche

Imbarcare è il vero affare. Se ti preoccupi principalmente dei potenziali problemi di salute genetica del tuo cane, questo kit dovrebbe essere la tua prima scelta; verifica semplicemente altri problemi. Solo per questo, vale $ 50 in più rispetto al prezzo di Wisdom Panel. Nei nostri risultati, la determinazione della razza è per lo più coerente. Con il background scientifico dell'azienda, ci sono poche ragioni per sentirsi meno che fiduciosi nei suoi risultati. Detto questo, molti dei dati presentati non sono necessari e complicati per il proprietario medio del cane.

Imbarcare la recensione e la valutazione del kit di test del DNA del cane